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高質(zhì)量向日葵基因組“來(lái)了”

作者:宋檢 時(shí)間:2022-11-29 來(lái)源:互聯(lián)網(wǎng)

英國(guó)《自然》雜志5月21日發(fā)表論文稱,法國(guó)卡斯塔內(nèi)托洛桑國(guó)家農(nóng)業(yè)研究院科研人員測(cè)序獲得了高質(zhì)量的向日葵參考基因組,這在此前是非常難以完成的。這一資源將為未來(lái)的研究提供幫助,有助于人們?cè)诳紤]到農(nóng)業(yè)限制因素和人類(lèi)營(yíng)養(yǎng)需求的前提下,利用遺傳多樣性改善向日葵的抗逆性和產(chǎn)油量。

 

向日葵是一種全球性的油料作物。由于能在包括干旱在內(nèi)的各種環(huán)境條件下保持穩(wěn)定的產(chǎn)量,這一物種可以說(shuō)顯示出了適應(yīng)氣候變化的希望。然而直到此前,研究者都難以完成向日葵基因組的組裝,因?yàn)樗饕怯筛叨认嗨频南嚓P(guān)序列組成的。加拿大、美國(guó)、法國(guó)政府部門(mén)及機(jī)構(gòu)都曾經(jīng)資助各自的研究團(tuán)隊(duì)對(duì)向日葵基因組進(jìn)行測(cè)定和分析。

 

此次,法國(guó)卡斯塔內(nèi)托洛桑國(guó)家農(nóng)業(yè)研究院科學(xué)家尼古拉斯·朗拉德及其同事,測(cè)序了向日葵的基因組,并進(jìn)行了比較和全基因組分析,為這一類(lèi)開(kāi)花植物——菊類(lèi)植物的演化史帶來(lái)了新啟示。同時(shí),向日葵基因組將可以成為菊科植物的模式基因組。菊科是目前世界上*大的植物科,共有24000種植物,其中包括多種作物、藥用植物、園藝作物和有害雜草等,向日葵基因組序列能夠?yàn)榱私庹麄€(gè)“家族”提供一個(gè)非常有用的模版。

 

本次研究中,團(tuán)隊(duì)成員還找到了新的候選基因,重構(gòu)了花期和油脂代謝這兩大育種性狀的遺傳網(wǎng)絡(luò),并發(fā)現(xiàn)花期的遺傳網(wǎng)絡(luò)是由*近的全基因組倍增塑造的。

 

這項(xiàng)研究意味著,在數(shù)千萬(wàn)年中,古老的橫向同源基因(基因組中由于倍增產(chǎn)生的同源基因)都能在同一調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中保留下來(lái)。論文作者*后總結(jié)稱,他們的研究強(qiáng)化了向日葵作為生物、演化和氣候變化適應(yīng)研究模型的地位,且有助于加快向日葵育種。

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