1、常規(guī)測序

　　常規(guī)測序：采用ABI 3730XL測序儀進(jìn)行測序，有效讀長可達(dá)800bp以上/反應(yīng)

　　樣品要求：基因組DNA、PCR擴(kuò)增產(chǎn)物、菌液、質(zhì)粒DNA等

　　結(jié)果形式：電子郵件發(fā)送序列文件

　　完成周期：24-48小時

　　2、二代測序技術(shù)服務(wù)

　　1)基因組de novo測序：用于獲得物種的全基因組序列圖譜，同時為后續(xù)研究提供參考序列。

　　實驗要求：

　　1、客戶需提供待測樣本及相關(guān)信息(組織樣品，質(zhì)量不少于10g;提取的基因組DNA：產(chǎn)量≥100mg，濃度≥50ng/ul;OD260/280值介于1.8～2.0之間;確保DNA無降解，無污染。DNA可分步提供)。

　　2、客戶應(yīng)提供相應(yīng)的背景材料，包括：樣本描述，預(yù)測基因組大小，分析要求等。

　　結(jié)果形式：

　　提供項目實驗報告和分析報告：實驗報告包括簡單的操作流程、試劑使用等情況;分析報告包括：基因組survey、組裝結(jié)果、基因結(jié)構(gòu)分析、重復(fù)序列分析、基因功能分析、比較基因組學(xué)分析、非編碼RNA分析。

　　完成周期：根據(jù)基因組復(fù)雜程度而定。

　　2)基因組重測序：用于在全基因組范圍內(nèi)進(jìn)行變異檢測(Indel，SNP)、進(jìn)行群體進(jìn)化分析、進(jìn)行遺傳圖譜構(gòu)建。

　　實驗要求：

　　1、客戶需提供待測樣本及相關(guān)信息(組織樣品，質(zhì)量不少于5g;提取的基因組DNA：產(chǎn)量≥20ug，濃度≥50ng/ul;OD260/280值介于1.8～2.0之間;確保DNA無降解，無污染。)。

　　2、客戶應(yīng)提供相應(yīng)的背景材料，包括：樣本描述，實驗?zāi)康?，必要的相關(guān)實驗設(shè)計內(nèi)容，分析要求等。

　　結(jié)果形式：

　　提供項目實驗報告和分析報告：實驗報告包括簡單的操作流程、試劑使用等情況;分析報告包括：數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計和評估、Mapping情況統(tǒng)計、SNP/INdel Calling分析、nsSNP-containing基因定位和功能注釋、相近物種進(jìn)化分析等。

　　完成周期：質(zhì)檢合格后40個工作日內(nèi)完成。

　　3)轉(zhuǎn)錄組測序：用于基因表達(dá)差異分析(質(zhì)和量)、發(fā)掘新基因、進(jìn)行RNA編輯分析。

　　實驗要求：

　　1、客戶需提供待測樣本及相關(guān)信息(組織樣品，質(zhì)量不少于5g;提取的總RNA：產(chǎn)量≥10ug，濃度≥50ng/ul;OD260/280值介于1.8～2.0之間;確保RNA無降解，無污染。)。

　　2、客戶應(yīng)提供相應(yīng)的背景材料，包括：樣本描述，實驗?zāi)康?，必要的相關(guān)實驗設(shè)計內(nèi)容，分析要求等。

　　結(jié)果形式：

　　提供項目實驗報告和分析報告：實驗報告包括簡單的操作流程、試劑使用等情況;分析報告包括：對于有參考基因組序列的轉(zhuǎn)錄組分析包括：數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計和評估、基因表達(dá)差異分析、差異表達(dá)基因GO富集分析、KEGG分析、SNP/Indel篩選、新基因查找、剪切位點統(tǒng)計、蛋白網(wǎng)絡(luò)互作等。對于無參考基因組序列的轉(zhuǎn)錄組分析包括：數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計和評估、de novo組裝結(jié)果、污染檢測、基因表達(dá)及差異分析、差異表達(dá)基因GO富集分析、KEGG分析、基因互作網(wǎng)絡(luò)分析、新轉(zhuǎn)錄本查找與LncRNA預(yù)測。

　　完成周期：質(zhì)檢合格后40個工作日內(nèi)完成(如果增加分析要求，時間順延)。

　　4)Small RNA測序：用于miRNA表達(dá)模式分析、miRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和靶點、發(fā)掘生物標(biāo)記物。

　　實驗要求：

　　1、客戶需提供待測樣本及相關(guān)信息(組織樣品，質(zhì)量不少于5g;提取的總RNA：產(chǎn)量≥50ug，濃度≥50ng/ul;OD260/280值介于1.8～2.0之間;小RNA：產(chǎn)量≥20ug，濃度≥200ng/ul;OD260/280值介于1.8～2.0之間;確保RNA無降解，無污染。)。

　　2、客戶應(yīng)提供相應(yīng)的背景材料，包括：樣本描述，實驗?zāi)康模匾南嚓P(guān)實驗設(shè)計內(nèi)容，分析要求等。

　　結(jié)果形式：

　　提供項目實驗報告和分析報告：實驗報告包括簡單的操作流程、試劑使用等情況;分析報告包括：數(shù)據(jù)質(zhì)控、參考序列比對、小RNA分類、rRNA，tRNA，snRNA，repeat sRNA和snoRNA鑒定、靶基因預(yù)測、堿基偏好性分析、差異表達(dá)分析、GO富集分析、KEGG分析、蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析。

　　完成周期：質(zhì)檢合格后40個工作日內(nèi)完成(如果增加分析要求，時間順延)。

　　5)全外顯子組測序：用于經(jīng)濟(jì)高效發(fā)掘外顯子區(qū)的致病位點及易感位點，發(fā)現(xiàn)稀有突變。

　　實驗要求：

　　1、客戶需提供待測樣本及相關(guān)信息(組織樣品，質(zhì)量不少于5g;提取的基因組DNA：產(chǎn)量≥50ug，濃度≥50ng/ul;OD260/280值介于1.8～2.0之間;確保DNA無降解，無污染。)。

　　2、客戶應(yīng)提供相應(yīng)的背景材料，包括：樣本描述，實驗?zāi)康?，必要的相關(guān)實驗設(shè)計內(nèi)容，分析要求等。

　　結(jié)果形式：

　　提供項目實驗報告和分析報告：實驗報告包括簡單的操作流程、試劑使用等情況;分析報告包括：數(shù)據(jù)質(zhì)控、與參考序列進(jìn)行比對、統(tǒng)計測序深度及覆蓋度、SNP/Indel檢測、注釋及統(tǒng)計、Somatic SNP/Indel檢測、注釋及統(tǒng)計。

　　完成周期：質(zhì)檢合格后40個工作日內(nèi)完成(如果增加分析要求，時間順延)。

　　6)甲基化測序：用于獲得單堿基精確度的全基因組DNA甲基化圖譜。

　　實驗要求：

　　1、客戶需提供待測樣本及相關(guān)信息(DNA樣品總量≥5ug，DNA樣品濃度≥152 0173 3840ng/ul)。

　　2、客戶應(yīng)提供相應(yīng)的背景材料，包括：樣本描述，實驗?zāi)康模匾南嚓P(guān)實驗設(shè)計內(nèi)容，分析要求等。

　　結(jié)果形式：

　　提供項目實驗報告和分析報告：實驗報告包括簡單的操作流程、試劑使用等情況;分析報告包括：數(shù)據(jù)質(zhì)控、參考序列比對、C位點覆蓋度統(tǒng)計、全基因組甲基化水平分析、甲基化位點檢測、差異甲基化區(qū)域分析、比對率統(tǒng)計、測序深度統(tǒng)計、染色體水平甲基化密度分布、不同基因組功能元件甲基化分布、CpG、CHG、CHH甲基化比例統(tǒng)計、功能注釋及富集分析等。

　　完成周期：質(zhì)檢合格后40個工作日內(nèi)完成(如果增加分析要求，時間順延)。