食物是人體獲取養分的主要途徑，食物的干凈衛生是身體健康的重要保障。而食品微生物檢測，是衡量動植物性產品衛生質量的重要指標之一，也是判定被檢產品能否食用的科學依據之一。
　　食物微生物檢測
　　市場監管部門發布的食物抽檢報告中，通常可以看到以下幾個抽檢項目：生物毒素超標問題；微生物污染問題；農獸藥殘留問題；重金屬污染問題；食品添加劑超限量使用問題等。其中，根據我國衛生部頒布的中華人民共和國國家標準(GB)食品衛生檢驗方法-微生物部分，微生物檢測主要有菌落總數、大腸菌群和致病菌3項。此外，微生物指標還包括病毒和寄生蟲指標等。
　　食物微生物檢測是判斷食品加工環境和食品安全的重要依據，作為食品微生物檢驗人員，在進行檢測時，必須嚴格按照規定操作，不得隨意更換其他方法進行微生物檢測。同時因為微生物檢測涉及到菌落總數等細菌相關數據，在取樣時就必須無菌采樣，以免造成樣品污染而使得檢測結果出錯。
　　無菌操作的要求
　　食物微生物檢測的主要程序包括(1)采集樣品、(2)樣品送檢、(3)樣品處理、(4)檢驗、(5)結果報告。在檢驗環節之前，每一個環節都有可能因為微生物進入而造成樣品污染，因此無菌操作技術應貫穿整個檢驗過程，一旦其中一個環節沒有采用無菌操作，那么其他環節的無菌操作也將沒有任何意義。
　　(1)采集樣品
　　樣品采集過程中使用的器械和容器均需滅菌處理，如剪刀、藥匙要經過170℃/2h 干熱滅菌，天平消毒處理。如樣品是直接食用的小包裝食品，可原包裝直接采集，檢驗前不要開封。
　　(2)樣品送檢
　　采集好的樣品應及時送到食品微生物檢驗室，一般不應超過3h。如路程較遠，則可將不需冷凍的樣品保持在1～5℃的環境中，勿使凍結，以免細菌遭受破壞。
　　(3)樣品處理
　　需用無菌刀、剪或鑷子稱取不同部位的樣品。一般而言，稱取 25g/ml樣品于盛有225ml無菌稀釋液的無菌均質袋中均質，制備成1:10樣品勻液進行檢驗。若是冷凍樣品必須事先在原容器中解凍，解凍溫度為2～5℃不超過18h或45℃不超過15min。
　　(4)檢驗
　　食品衛生微生物檢測單位接到檢驗申請單，應立即登記填寫試驗序號，并在36 h內進行檢測(貝類樣品通常要在6 h內檢測)。對不能立即進行檢測的樣品，實驗室應有足夠和適當的樣品保存設施(如冰箱或冰柜等)，使樣品在檢測之前維持取樣時的狀態。
　　(5)結果報告
　　樣品檢驗完畢后，檢驗人員應及時填寫報告單。檢驗人員和主管核實簽字并加蓋公章后，結果報告生效。如樣品檢驗結果陽性，應按照規定保存時間保存。
　　2020年10月，黑龍江“酸湯子中毒事件”中9名中毒者已全部死亡，致死原因就是自制的酸湯子被致病菌椰毒假單胞菌污染。
　　自制發酵食物和陰暗潮濕的環境都*容易導致食物微生物超標甚至染上致病菌。近段時間正是春雨頻繁時節，小作坊環境雜亂，在生產過程中*有可能導致食物微生物含量超標。而微生物檢測的意義就在于此，能夠對產品被微生物污染的程度作出正確的評價，有效地防止或者減少因食用不潔食物而導致的疾病，保障人民的身體健康。