微生物菌劑是用于改善土壤微生物菌群環境，抑制有害菌群，提高作物抗逆性，加速土壤生物多樣性及有機質礦化速度、釋放土壤微量元素、金屬離子及養分等等目的生產的肥料菌劑。按照國家，肥料登記管理規定，微生物菌劑想要上市銷售，就必須取得肥料登記證明，也就是要通過的備案審批。

　　GB 20287-2006規定，該標準適用于根瘤菌菌劑檢測、固氮菌菌劑檢測、解磷類微生物菌劑檢測、硅酸鹽微生物菌劑檢測、光合細菌菌劑檢測、有機物料腐熟劑檢測、促生菌劑檢測、菌根菌劑檢測、生物修復菌劑檢測等，除此之外液體微生物菌劑檢測、粉劑微生物菌劑檢測、顆粒型微生物菌劑也適用該標準。

　　GB 20287-2006將微生物菌劑檢測項目分成三大類，分別為菌種質量評價要求，產品外觀要求以及技術指標要求。其中技術指標又細分為農用微生物菌劑產品技術指標要求、有機物料腐熟劑產品技術指標要求、農用微生物菌劑產品無害化指標要求。詳細要求如

　　微生物菌劑產品必須達到以上檢測要求，才能完成合格報告測試。除此之外，由于微生物菌劑從生產出來之后還會繼續一代一代繁殖，所以就造成菌劑在銷售時， 已經老化過期，肥田能力降低，而且微生物對環境、人畜健康及生態安全影響，都需要進行科學有效的評價，這時就需要我們根據HJ/T 415-2008《環保用微生物菌劑環境安全評價導則》等相關標準進行評價測定。值得一提的是，微生物菌劑肥料登記，企業生產管理及加工技術也需要進行檢測檢驗，在此可以依據NY/T 883-200《農用微生物菌劑生產技術規程》中的規定。