由于水污染在水體中的表現是不均勻的，采樣也是在動態的水體中進行，如何在流動式的水體中采集到具有代表性、能真實反映污染水平的試樣，做好水質檢測分析，應在以下幾個環節中做好質量控制工作。
掌握監測河段的水文特征、河流運動特點。
水質監測必須通過有效的采樣方法和科學的布點原則，準確尋找所排放的污染物在水體中均勻分布的斷面和采樣點位置，以合理的采樣頻率，采集具有代表性的水樣，從而能以較少的采樣斷面和水樣，來獲取足以反映河流水質污染水平的信息。
對于一般小的河流，上述工作并不復雜，而對于較大的河流，則因所排放的污水量相對于河水流量來說為較小，往往容易在岸邊形成較長的污染帶，遂使污染物和河水充分混合的斷面離污染源較遠。因此，在確定采樣斷面時，必須充分考慮到這點。
污染物和河水的充分混合受多種因素牽制，從整個流域看，河床的形態、坡降、糙度、河道變化和河水流速決定了河水的力學性質，導致了水質點的不同運動方式，也決定了污染物縱向、橫向的不同變化特點和污染物在水體中的不同擴散能力。
河流按其運動特點可分為流速大的主流帶、近岸滯流帶和處于主流、滯流之間的過渡帶。主流帶是河床斷面水流速度大的部份，在河床的地形、糙度、河道彎曲及礁石影響下，有助于水紊流運動的產生。隨著水質點的不斷向前推進，過渡帶、滯流帶的水質點不斷向主流帶方向移動，終達到棍合。如不了解河水運動的特點，不掌握污染帶的生、消規律，而在污染物尚未與河水充分混合的位置布設采樣斷面和采樣點，則所汲取的污染物濃度信息就不能反映該河流的污染水平。可見，掌握河流水文地質資料，了解污染物稀釋擴散規律，對于采樣斷面的合理布設，是必不可少的基礎工作。
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