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微生物學技術服務

作者:百檢網 時間:2021-12-06 來源:互聯網

  1、微生物檢驗;

  1)微生物常規定性、定量檢測:

  適用于食品、藥品、水、飼料、環境樣品中的細菌總數、大腸菌群、大腸埃希氏菌、沙門氏菌、志賀氏菌、金黃色葡萄球菌、霉菌和酵母菌、單核細胞增生李斯特氏菌、雙歧桿菌、乳酸菌、副溶血性弧菌、蠟樣芽孢桿菌等。GB 4789食品安全國家標準食品微生物學檢驗、2015版藥典、GB 152 0173 3840醫療機構水污染物排放標準、GB 5750.12生活飲用水標準檢驗方法微生物指標、GB 13078飼料衛生標準等33項CNAS認證項目、13項CMA認證項目及12項CMAF認證項目。

  實驗要求:送檢樣品>50g。

  結果形式:樣品質檢報告。

  完成周期:收到樣品后5-10個工作日內完成,檢測時間隨檢驗項目及樣品本身情況而變。

  2)微生物方法學檢測:

  適用于藥品、食品等樣品的微生物限度檢查法方法學驗證、無菌檢查法、細菌內毒素檢查、藥品效價檢測的抑菌試驗(牛津杯法、濾紙片法、微量肉湯稀釋法(96微孔板法))。

  實驗要求:送檢樣品>10g。

  結果形式:樣品質檢報告。

  完成周期:收到樣品后10-15個工作日內完成,檢測時間隨檢驗項目及樣品本身情況而變。

  3)外源性DNA殘留量檢測:

  適用于藥品、醫療器械等樣品中的外源性DNA核酸殘留量的檢測。

  實驗要求:送檢樣品>10g。

  結果形式:樣品質檢報告。

  完成周期:收到樣品后10-15個工作日內完成,檢測時間隨檢驗項目及樣品本身情況而變。

  4)生物相:

  適用于細菌、真菌、藻等樣品的掃描電鏡顯微觀察。

  實驗要求:客戶需提供生長狀態良好的細菌、真菌、藻。

  結果形式:樣品質檢報告、電鏡圖片。

  完成周期:收到樣品后10個工作日內完成。

  2、微生物鑒定;

  1)菌種鑒定:

  適用于從食品、藥品、水、飼料、環境等各種樣品中分離得到的微生物(細菌、放線菌、真菌、藻類)菌種分析。針對細菌16S rDNA、16-23S rDNA,真菌ITS、18S rDNA等進行特異性擴增后,進行克隆測序;必要時,使用顯微鏡進行微生物形態學觀察、生理生化實驗、革蘭氏染色等手段進行輔助鑒定。

  實驗要求:客戶需提供濃度>20ng/ul,OD260/280=1.8的DNA,要求提取DNA的除外。

  結果形式:提供給客戶所需要的細胞株以及該細胞的培養方案。

  完成周期:收到細胞株后3周內提供

  2)熒光定量PCR檢測:

  適用于食品、水、活性污泥、飼料、環境等樣品中特定微生物種群的動態變化的定量和定性分析,可以使用Sybre Green I燃料法和Taqman探針法。

  實驗要求:需要做taqman探針法的客戶需提供探針,需要我們合成探針的需加收探針合成費,要求使用客戶提供的方法的需要額外加收預實驗費。

  結果形式:提供給客戶所需要的細胞株以及該細胞的培養方案。

  完成周期:收到細胞株后3周內提供

  3) BIOLOG自動微生物鑒定系統:

  BIOLOG自動微生物鑒定系統可鑒定包括細菌、酵母和絲狀真菌在內近2650種微生物,幾乎涵蓋了所有的人類、動物、植物病原菌和食品及環境微生物。其使用微孔板可以對微生物進行94種表型測試,其中包括:71種碳源利用測試以及23種化學敏感性測試。微生物在測試板上所顯示出的“表型指紋”被用來在種的水平上鑒定該微生物。

  3、微生物多樣性分析;

  1)變性梯度凝膠電泳(PCR-DGGE):

  適用于活性污泥、水體、動物腸道、土壤、堆肥等樣品中微生物菌群結構及多樣分析。通過提取樣品中微生物基因組總DNA,擴增特異性目的片段,通過DGGE電泳,能夠區分1個堿基差異的序列片段,通過對差異片段的切膠回收,進行克隆測序后進行序列比對,進行菌種分析,同時進行膠圖的聚類分析、泳道相似性分析及微生物多樣性指數分析。

  實驗要求:因樣品中的微生物處在動態消長的過程中,提取DNA時可能出現不能滿足PCR要求而需要重新提取時,實驗時間適當延長;當因樣品原因需要重新送樣時,檢測時間重新計算。DGGE每板膠*大上樣量為16個樣品,客戶需要提供上樣順序。切膠測序使用克隆測序,測序成本高,因此每板膠的切膠測序數量為此板膠樣品數×1.5,當客戶需要切取更多條帶是,多出的條帶按照250元/條收取克隆測序費用。因曝光時間與強度存在差異的情況,原則上板與板之間不進行數據分析及比較。

  結果形式:提供檢測報告、實驗方法與流程、數據分析。

  完成周期:提取的DNA質量達到后續實驗要求后開始25-40工作日內完成。

  2)克隆文庫:

  適用于活性污泥、堆肥、功能性液體、飼料等樣品中微生物菌群結構及多樣性分析。通過提取樣品中微生物基因組總DNA,使用統一的引物序列擴增目的片段,通過連接載體,轉染大腸桿菌,進行藍白斑篩選,挑取陽性克隆子,進行雙限制性酶切反應篩選,將不同序列進行克隆測序后,進行OUT分型,對樣品中微生物菌群結構進行系統性分析。

  實驗要求:因樣品中的微生物處在動態消長的過程中,提取DNA時可能出現不能滿足PCR要求而需要重新提取時,實驗時間適當延長;當因樣品原因需要重新送樣時,檢測時間重新計算。

  結果形式:提供檢測報告、實驗方法與流程、數據分析。

  完成周期:提取的DNA質量達到后續實驗要求后開始30工作日內完成。

  3)宏基因組分析

  指特定環境下所有生物遺傳物質的總和。宏基因組學是以生態環境中全部DNA為研究對象,篩選有用基因,研究其功能和批次之間的關系,并揭示其規律的一門學科。

  實驗要求:

  1、客戶需提供待測樣本及相關信息(腸道食糜樣品/土樣/植物根系,質量不少于10g;提取的基因組DNA:產量≥10μg,濃度≥50ng/ul;OD260/280值介于1.8~2.0之間;確保DNA無降解,無污染)。

  2、客戶應提供相應的背景材料,包括:樣本描述,實驗目的,必要的相關實驗設計內容,分析要求等。

  結果形式:

  提供項目實驗報告和分析報告:實驗報告包括簡單的操作流程、試劑使用等情況;分析報告包括:序列拼接、基因預測、微生物組成分析、功能注釋,包括Nr注釋、COG分析和KEGG分析。從而獲得各樣品參與代謝基因、不同樣品功能基因的差異、主成分分析、參與某物質代謝的基因以及代謝通路分析等。

  完成周期:質檢合格后40個工作日內完成。

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