為不斷提高機采棉采收質量，昌吉州積*走出去學習兵團種植經驗，選擇適合本地氣候條件的早熟品種(如新陸早57號、61號、72號等)，推廣應用衛星定位導航自動駕駛技術、雙膜覆蓋、化學打頂等先進技術，全方位開展農機農藝技術融合。依托昌吉州農業首席專家制度，成立棉花首席專家組，農業、農機專業技術人員共同指導機采棉生產技術環節，有效保障了昌吉州棉花生產水平的提高。2017年制定出臺了昌吉州棉花生產全程機械化作業技術規程，并加以大力推廣實施，對提升昌吉州機采棉種植水平，起到了巨大的推動作用。

2018年，為進一步推進棉花供給側結構性改革深入開展，探索新形勢下棉花節本增效新模式，昌吉州在2017年開展棉花供給側結構性改革試點工作的基礎上，繼續在瑪納斯縣進行棉花供給側結構性改革試點，帶動昌吉州西部縣市優質棉生產基地全產業鏈提質增效，全面提升棉花品質、植棉收益和市場競爭力。試點工作將從推進棉花單品種植、適度規模經營、實施標準化種植、優化軋花工藝流程、形成產加銷一體化利益聯結機制和棉花優質優價機制等方面入手，破解棉花全產業鏈發展難題，探索棉花提質節本增效路徑。