食物從農(nóng)場(chǎng)到餐桌要經(jīng)過(guò)多個(gè)環(huán)節(jié)，每一個(gè)環(huán)節(jié)都有眾多的參與者。含有轉(zhuǎn)基因成份的農(nóng)產(chǎn)品品種多，數(shù)量大，尤其是含有轉(zhuǎn)基因成份的食品，成份復(fù)雜，要分離基因作物和非基因作物困難重重，成本相當(dāng)高。僅含少量比例的轉(zhuǎn)基因成份，或核酸或蛋白質(zhì)等待檢測(cè)成份已被降解或破壞，都會(huì)加大檢測(cè)難度。而對(duì)轉(zhuǎn)基因成份的檢測(cè)，必須準(zhǔn)確、快速、靈敏、可靠。

　　食品轉(zhuǎn)基因成份的檢測(cè)關(guān)鍵問(wèn)題是，食品中含有油、鹽、糖和其他蛋白質(zhì)，加工后的食品在DNA的抽提過(guò)程中，要保證其DNA的純度，不受污染和降解。

我國(guó)應(yīng)用新的檢測(cè)方法，對(duì)部份進(jìn)口農(nóng)產(chǎn)品進(jìn)行檢測(cè)，從中檢出轉(zhuǎn)基因成份。利用生物芯片技術(shù)原理，適合口岸大樣品量的檢測(cè)，解決了轉(zhuǎn)基因檢測(cè)中樣品核酸制備的難題，同時(shí)提高了樣品檢測(cè)自動(dòng)化程度，提高了檢測(cè)靈敏度和穩(wěn)定性，降低了檢測(cè)成本和時(shí)間。

在傳統(tǒng)的生物實(shí)驗(yàn)室中用人工測(cè)定，速度較慢，測(cè)定十幾個(gè)DNA片斷的序列，約合4000個(gè)堿基對(duì)，至少需要一個(gè)工作日。用儀器檢測(cè)，即PE3700-DNA序列分析儀及同類儀器，一個(gè)工作日可測(cè)定近2000個(gè)DNA序列，約合70萬(wàn)個(gè)堿基對(duì)。生物芯片的初級(jí)形式用于檢測(cè)生物樣品中基因表達(dá)譜的改變。有一種不成熟的生物芯片在15分種完成了1.6萬(wàn)個(gè)堿基對(duì)的測(cè)定，96個(gè)這樣的生物芯片平行工作，就相當(dāng)于每天1.47億個(gè)堿基對(duì)的分析能力。

目前對(duì)轉(zhuǎn)基因作物的檢測(cè)取得了進(jìn)展。通過(guò)對(duì)轉(zhuǎn)基因成份所獨(dú)有的DNA序列來(lái)提示基因表達(dá)譜。一種新方法能精確測(cè)試出深加工的食品中是否含有微量轉(zhuǎn)基因大豆或玉米的成份以及配料中轉(zhuǎn)基因成份的具體比例。據(jù)研究人員對(duì)一塊面包進(jìn)行的研究，發(fā)現(xiàn)其中含0.67%的豆粉成份，用新的方法進(jìn)行進(jìn)一步精確分析后，他們成功地發(fā)現(xiàn)這些微量豆粉中2%為轉(zhuǎn)基因成份。