國家氣象中心消息，2011年6月主要農業氣象災害為暴雨洪澇、干旱和風雹。其中，月內長江中下游沿江地區出現旱澇急轉，致使部分地區棉花等農田被沖毀或受淹，農業設施受損或被毀，農業生產遭受一定損失。其它農業氣象災害包括熱帶風暴、高溫和干熱風、病蟲害等，對農業生產影響較輕。


長江中下游地區（3～7日、9～11、13～15日、17～19日和23～25日）出現5次強降水過程，大部地區累計降雨量有300～500毫米，局部地區達800毫米，普遍比常年同期偏多5成至2倍。強降水有效補充了土壤水分和庫塘蓄水，使前期干旱得到了緩解；但同時也導致湖北東部和西南部、安徽南部、江蘇南部、江西北部、浙江北部等地的局部地區出現嚴重暴雨洪澇災害，農業設施損毀，部分棉花等農田被沖毀或受淹；多雨寡照還導致受淹棉花長勢偏差。據不完全統計，暴雨洪澇導致江西、湖南、湖北、浙江、安徽等省月內農作物受災面積2096千公頃，絕收152 0173 3840千公頃。

6月上中旬，我國北方大部地區降水量不足50毫米，比常年同期偏少3～8成，加之氣溫偏高，導致土壤失墑較快，西北地區東部、華北南部、黃淮西部和南部出現輕至中度農業干旱，不利于春播作物生長和夏播作物播種出苗。下旬北方大部出現明顯降水，農區干旱范圍明顯縮小、程度減輕，利于棉花現蕾。至月末，僅陜西北部、甘肅東北部、山西中南部、河南西北部墑情仍較差。據

6月全國共有23個省（市、區）相繼遭受雷雨大風或冰雹襲擊，其中河北、新疆等地局部受災較重，累計農作物受災面積超過350千公頃，絕收近65千公頃。大風冰雹造成局地棉花等被砸壞。 因風雹災害導致農作物受災面積統計數據顯示，6月15日，新疆昌吉州、巴音郭楞、阿克蘇、喀什、伊犁5地區（州）12個縣（市、區）農作物受災16.4千公頃，絕收4千公頃。

7月，東北地區東南部降水偏多，可能出現農田濕漬害；華北大部、黃淮、江淮北部、江漢降水偏多，可能出現多雨寡照天氣，不利于棉花開花結鈴和；江南大部氣溫偏高,長江中下游和江南北部等地高溫日數（日*高氣溫≥35℃）較常年同期偏多2～4日。