一、病害
　　1、苗病種類和危害特點。棉苗從子葉期到1-2片真葉期*易感染各類病害。立枯病、炭疽病、紅腐病等病害危害棉苗根部；而黑斑病、輪紋斑病、疫病、褐斑病等危害葉部；莖枯病危害幼莖及生長點。這些病害在多雨、陰濕、低溫或冷暖氣候劇烈反復時*易發生，且往往是混合并發，成災較多。輕的引起僵苗、病苗，重的導致爛芽、爛根，葉枯莖腐，缺苗斷壟，甚至成片死亡。
　　 2、防治方法。一是控制苗床水分和溫度。營養缽棉棉苗出齊到子葉平展后，要在苗床兩端揭膜通風降濕煉苗，并搶晴天曬床1到2天，曬到苗床表土發白、苗莖的三分之一發紅，堅持晴天揭膜通風，降溫散濕，到下午5點要蓋膜保溫，如果遇到低溫寒潮，應該全天覆膜。二是加強田間管理。棉花移栽后要深中耕、勤中耕，以提高土溫，降低土壤濕度，使土壤通氣；陰雨天時，要開溝排漬，以利根系發育。對于出現的病苗、死苗應及時清除出田，集中處理，以減少田間病菌數量及傳染機會。三是加強化學防治，以預防為主。齊苗后每隔10天噴一遍20%稻腳青600-800倍液或50%多菌靈500－800倍液，能很好地防治根病。噴施半量式波爾多液（1:1:200比例），能很好地防治各種葉病，防治葉病還可用或托布津800-1000倍液，或98%惡霉靈5000倍液噴施。
　　二、蟲害
　　1、蟲害種類和危害特點。從播種到現蕾前，危害種子和幼苗根部的有種蠅、金針蟲、蠐螬等。咬斷嫩莖和咬食葉片的有地老虎和蝸牛，刺吸汁液的有棉蚜、棉薊馬、盲蝽蟓和棉葉螨等。棉苗受這些蟲危害后，導致棉苗植株矮小，葉片變小，失綠變紅有斑點、有缺點、有的缺整片葉。地老虎能夠咬斷棉莖，造成棉花缺苗斷壟；發生棉葉螨后，棉苗呈火燒狀；發生棉蚜后，棉株形成“龍頭”葉片卷縮，導致根系發育不良，生長停滯，并推遲現蕾。發生棉薊馬后，子葉期形成“公棉花”或“破頭棉”，嫩棉葉受害葉背出現白色斑點或白帶；發生盲蝽蟓，子葉期受害出現“破葉瘋”，頂芽受害成多頭棉，為害花蕾，造成花蕾脫落。
　　2、防治方法。防治地老虎等地下害蟲，*好用棉子餅拌藥，喂殺，每畝用90%敵百蟲50克，加水1000毫升噴灑到2500克炒香的棉子餅里，于傍晚撒在棉苗旁邊，每隔一定距離撒一小堆，第2天早晨到棉苗旁撿蟲子；防治棉蚜可用50%抗蚜威可濕性粉劑每畝50-70克，1000-1200倍液噴施到棉葉及莖上；防治棉薊馬可用3.5%甲敵粉每畝2千克噴粉；防治棉葉螨可用73%克螨特1000-152 0173 3840倍液噴施。盲蝽蟓用152 0173 3840-2000的撲殺靈、盲蝽絕殺、蝽蟓一蓋清或蝽凈蚜無蹤，噴治盲蝽蟓應在傍晚或早晨為好。
　　三、波爾多液的正確配制和使用
　　1、波爾多液的配制比例
　　波爾多液的配制比例有多種不同的方式，可分為等量式、半量式、過量式、倍量式，配制比例若為1：1：100（硫酸銅：生石灰：水）稱為100倍等量式波爾多液。以硫酸銅為標準如1：1.5：200，為200倍石灰過量式波爾多液。對于幼嫩組織或對銅元素敏感的植物，可用濃度較低或石灰過量式配制；對石灰敏感的植物，則可采用石灰少量式的各種稀釋倍數噴霧。棉花苗期病害一般采用半量式，即1：1：200。
　　2、波爾多液的配制方法
　　配制方法*好用80%的水用于溶解硫酸銅，用20%的水將生石灰化成濃的石灰乳，然后，把硫酸銅溶液慢慢地倒入石灰乳中，同時加水不斷地攪拌，直到全部混合均勻為止，配合好的波爾多液為穩定的堿性膠體懸液，PH值為8-9。要求波爾多液應現配現用，時間放置長后會逐漸沉淀，顆粒變大，出現結晶而變質，影響藥效。沉淀快慢可作為判斷配制波爾多液質量的好壞。
　　3、波爾多液的殺菌原理
　　波爾多液具有很強的保護性殺菌能力，藥效范圍很廣，成本低，比較經濟實惠，預防病害效果好。其粘著力強，耐雨水沖刷，作用持久，一般可保持15～20天。波爾多液的有效成分主要是堿式硫酸銅，將其噴在植物上可形成一層藥膜附于植物表面，藥膜在植物及病菌的分泌物、有機酸及空氣中的二氧化碳等綜合作用下，波爾多液中銅鹽溶解釋放出銅離子，銅離子進入病菌體內致細胞原生質蛋白質凝固變性而殺死病菌，卻不傷害植物。
　　4、適用范圍及注意事項
　　適用于多種作物，可防治黑斑病、輪紋斑病、角斑病、霜霉病、疫病、葉斑病等多種莖葉病害，兼殺紅蜘蛛。波爾多液是強堿性農藥，不能與有機磷農藥混用。使用后須間隔10～15天，才能使用礦物油乳劑和石硫合劑。選擇晴天在上午11時前和下午4時后噴霧。