近年來，病害的危害已成為制約棉花產量與品質的重要因素之一。有些病害，剛開始癥狀不明顯，容易被忽視，待到嚴重時再采取措施為時已晚。特別是重茬地塊，棉農對一些常發病害、土傳病害很是頭疼，常有束手無策之感。為此，對于棉花病害要“預防為主，治療為輔”。 　　　
　　棉花的病害比較多，但*讓棉農感覺到頭痛的主要有兩個病害：一是出苗后立枯病引起的死苗問題，二是黃枯萎病。這兩個病害也是多年來棉農防治的誤區，一來不知道選用什么樣的藥劑，市場上藥劑種類太多、五花八門，真真正正起作用的藥劑不多，造成棉農朋友們選藥不準；二來對預防的時間也不了解，等到病害已經完全起來了再去用藥，已經造成了很大的損失，所以使許多棉農朋友們有一個錯誤的觀念――棉花的病害沒法治。 　　　
　　針對于棉花病害防治如下： 　　　
　　1.苗期病害――立枯病（死苗）。棉苗出土后，莖基部（和地皮相接地方）出現黃褐色病斑，逐漸擴大，凹陷、腐爛，顏色黑褐，棉苗枯死。農民俗稱“黑脖子”病。棉苗出土后15天以內抵抗力*弱，遇低溫、高濕苗病發生嚴重，而且越連作越重。因此防治時掌握兩點：①播種前包衣，每2～3斤種子用高巧10毫升＋家園益微50克拌種包衣，不但防治立枯病和黃枯萎病，還可以起到增產的作用；②棉花出苗后及時噴藥劑預防，防效*佳的藥劑為：瑞苗清2000倍液＋碧護152 0173 3840倍液，噴淋到棉苗根莖部即可有效防治死苗現象。 　　　
　　2.枯黃萎病。棉花枯萎病、黃萎病都能為害棉花的維管束組織，造成維管束堵塞，引起棉花葉片黃化、干枯、脫落，棉株變成光稈，植株萎蔫，以致枯死。 　　　
　　防治方法： 　　　
　　1.前期預防：在棉花生長的前期（5月25日、6月23日）進行兩次必要的藥劑預防，選用瑞苗清（2000倍液）＋家園益微（750倍液）噴霧，防效高達90％以上。 　　
　　2.發病后用瑞苗清（2000倍液）＋家園益微（750倍液）或好力克（5000倍液）＋枯萎黃萎大救星（750倍液）噴淋灌根，能有效的控制病害的發展。