5月初全國春播棉花基本結束，長江和黃河正處移栽期，西北棉花定苗基本結束。然而，5月氣候多變，低溫、高濕或干旱交替發生，病蟲害也進入重發期。棉花生產管理要以保全苗，育壯苗為重點。加強技術指導，組織專家和技術人員，進村入戶，開展田間地頭巡回診斷，切實幫助棉農解決生產實際問題。主要措施：查苗補種補移，逐地塊檢查苗情，發現死苗，要及時補種和移栽補苗，以保證足夠的苗數。5月初西北棉區遭遇低溫和凍害，要逐田檢查，及時補種。
及時放苗，放高溫燒苗。根據天氣預報，當*高氣溫達到30℃以上，地膜覆蓋要及時放，防高溫“燒苗”。
及時間苗定苗，防止苗荒苗，**次間苗保證棉株葉片搭葉片，當真葉2~3片時可以定苗。
“裸苗”移栽棉花，要求開溝深淺合適，做到“栽棉如栽菜”，澆足“安家水”，一株棉花澆一斤水，提倡地膜覆蓋，促進早發。長江油菜收獲后，搶時間移栽油菜后棉花。
排水和灌溉。長江進入梅雨期，要保證溝渠暢通；黃河小麥正處需水高峰期，要灌溉補水，防止麥棉爭水導致弱苗遲發和死苗。
中耕除草，提高地溫。對行間、株間和機械作業走道進行中耕，有利提高地溫，防除雜草。
防治病蟲害。苗期病害有立枯病、炭疽病和猝倒病等，使用半量式波爾多液噴灑防病效果好，配制方法：硫酸銅∶生石灰∶水的比例為0.25∶0.5∶50。其他防病藥劑有多菌靈和福美雙。
苗期害蟲有苗蚜、地老虎、薊馬和蝸牛等，苗蚜和薊馬用久效磷防治；地老虎用敵百蟲配制毒餌防治，蝸牛用“凱撒”、“滅蝸靈”和生石灰防治。