從2014年開始，新疆將結束棉花敞開收儲的政策方式，試點對棉農進行直補。國家發改委已確定新疆作為棉農直補政策的**試點區域，計劃將過去行政色彩濃厚的棉花臨時收儲政策改為強化市場作用的棉農直補政策。
棉花收儲政策的變化也成為自治區十二屆人大二次會議各棉花主產區地州代表團熱議的問題。棉花產量占全疆棉花總產量1/3的阿克蘇地區代表團向大會提交議案，建議根據國際棉花產業大環境和市場供求情況，按照“穩定面積、科學投入、提高單產、改善品質”的原則，對種植棉花的農民進行補貼，鼓勵農民種植優質棉花，全面提升棉花品質，促進棉花產業可持續健康發展。
對于棉農補貼標準，阿克蘇地區代表團建議，實行價格差額補貼后的籽棉均價應保持在9元/公斤（合皮棉價22.5元/公斤）以上才較為合理，即當市場籽棉平均收購價格低于基準價9.0元/公斤時，按實際收購價與基準價之間的差額由國家財政進行補貼，如籽棉平均收購價格高于9.0元/公斤，則不需要補貼。每公斤9元的基準價是根據當地多年的測算情況及棉花生產物化投入成本和人工成本核算出來的。
阿克蘇地區代表團還建議，棉花直補可采用現行的“糧食直補”兌付模式進行，即：根據銷售票據采取當年收購當年補貼的方式（即時銷售即時兌付），兌付時間應于當年完成。
目前，新疆棉花總產量已經連續20年位居全國**，是*具比較優勢的棉花產區。去年，全疆棉花種植總面積為2538萬畝，棉花總產量351.8萬噸，與上年持平。