作者:百檢網(wǎng) 時(shí)間:2022-06-20 來(lái)源:互聯(lián)網(wǎng)
百檢網(wǎng)資訊:研究人員開(kāi)發(fā)了一種計(jì)算DNA液滴,能夠識(shí)別作為腫瘤生物標(biāo)志物的化學(xué)合成microRNA的特定組合。通過(guò)大分子中的液-液相分離(或凝聚)形成水滴是生命科學(xué)研究中的熱門(mén)話(huà)題。在這些形成液滴的各種大分子中,DNA是*有趣的,因?yàn)樗强深A(yù)測(cè)和可編程的,這些特性在納米技術(shù)中很有用。*近,DNA的可編程性被用于構(gòu)建和調(diào)節(jié)由序列設(shè)計(jì)的DNA凝聚形成的DNA液滴。
日本東京工業(yè)大學(xué)的科學(xué)家開(kāi)發(fā)了一種計(jì)算DNA液滴,能夠識(shí)別作為腫瘤生物標(biāo)志物的化學(xué)合成microRNA(miRNA)的特定組合。使用這些miRNA作為分子輸入,液滴可以通過(guò)物理DNA液滴相分離給出DNA邏輯計(jì)算輸出。他們的研究結(jié)果發(fā)表在AdvancedFunctionalMaterials上。
“已經(jīng)報(bào)道了DNA液滴在受細(xì)胞啟發(fā)的微隔室中的應(yīng)用。盡管生物系統(tǒng)通過(guò)將生物傳感與分子邏輯計(jì)算相結(jié)合來(lái)調(diào)節(jié)其功能,但沒(méi)有關(guān)于DNA液滴與分子計(jì)算集成的文獻(xiàn),”首席研究員MasahiroTakinoue教授解釋說(shuō)。
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開(kāi)發(fā)這種DNA液滴需要一系列實(shí)驗(yàn)。**,他們?cè)O(shè)計(jì)了三種類(lèi)型的Y形DNA納米結(jié)構(gòu),稱(chēng)為Y基序A、B和C,具有三個(gè)粘性末端,以制造A、B和CDNA液滴。通常,相似的液滴會(huì)自動(dòng)結(jié)合在一起,而要連接不同的液滴則需要特殊的“連接器”分子。因此,他們使用連接分子將A液滴與B和C液滴連接起來(lái);這些接頭分子分別稱(chēng)為AB和AC接頭。
在他們的**個(gè)實(shí)驗(yàn)中,他們通過(guò)引入兩個(gè)輸入DNA來(lái)評(píng)估AB液滴混合物中的“與”運(yùn)算。在此操作中,輸入的存在記錄為1,而其不存在記錄為0。AB液滴混合物的相分離僅發(fā)生在(1,1),這意味著當(dāng)兩個(gè)輸入DNA都存在時(shí),表明AND操作的成功應(yīng)用.在這項(xiàng)研究之后,科學(xué)家們決定將乳腺癌腫瘤標(biāo)志物miRNA-1和miRNA-2引入AC液滴混合物作為AND操作的輸入。AND操作成功意味著計(jì)算DNA液滴識(shí)別了miRNA。
在隨后的實(shí)驗(yàn)中,該團(tuán)隊(duì)展示了AB混合物與miRNA-3和miRNA-4乳腺癌生物標(biāo)志物的同時(shí)AND和NOT操作。*后,他們創(chuàng)建了一種ABC液滴混合物,并將所有四種乳腺癌生物標(biāo)志物引入該解決方案。ABC液滴中的相分離取決于接頭裂解,導(dǎo)致兩相分離或三相分離。
ABC液滴的這一特性使研究人員能夠證明能夠檢測(cè)一組已知的癌癥生物標(biāo)志物或同時(shí)檢測(cè)三種疾病的標(biāo)志物。
“如果可以開(kāi)發(fā)出可以集成和處理多個(gè)輸入和輸出的DNA液滴,我們可以將其用于早期疾病檢測(cè)以及藥物輸送系統(tǒng)。我們目前的研究還為開(kāi)發(fā)智能人工細(xì)胞和分子機(jī)器人的研究奠定了基礎(chǔ),”Takinoue總結(jié)道。
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